La innovación en las empresas corresponde a la Consejería de Economía y Empleo, a través de la Agencia de Innovación, Financiación e Internacionalización Empresarial de Castilla y León (ADE), de la Dirección General de Industria y del Ente Regional de la Energía (EREN). Entre los instrumentos utilizados para el apoyo a la innovación caben señalar:

• Los préstamos para la realización de proyectos de I+D.
• Las subvenciones dirigidas a proyectos en cooperación para la implantación de soluciones tecnológicas innovadoras basadas en las TICs.
• El Programa de Formación de Gestores de I+D+I (GESTIDI) que contempla la formación de titulados universitarios desempleados de la región en el ámbito de la gestión de la innovación, para incorporarlos a diferentes empresas y agrupaciones empresariales innovadoras.
• El Programa de Formación de Técnicos y Directivos en I+D+I , orientado a empresas, agrupaciones de empresas innovadoras y otros agentes del sistema regional de ciencia y tecnología de Castilla y León con el fin de favorecer la incorporación de las herramientas de innovación en el sector empresarial regional.
• Los servicios especializados del sistema de innovación para las empresas, tales como asistencia tecnológica especializada, equipamiento tecnológico, etc., para el desarrollo de sus actividades de innovación.
• La aceleradora de empresas innovadoras de Castilla y León ADE2020 cuya misión es conseguir que los emprendedores lleven, en el menor plazo posible, su idea al mercado.
• Los proyectos de innovación en materia de energía en los que participa el Ente Regional de la Energía (EREN).